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本大隊隸屬於臺北市政府警察局,置大隊長,承警察局局長之命,綜理大隊業務,置副大隊長、技正,襄理大隊業務,下設8組、2室、1中心、9偵查隊及1中隊,組織架構圖如下:

大隊部 行政組 督察組 預防組 偵查組 肅竊組 經濟組 紀錄組 司法組 人事室 會計室 偵查第一隊 偵查第二隊 偵查第三隊 偵查第四隊 偵查第五隊 偵查第六隊 偵查第七隊 偵查第八隊 科技犯罪偵查隊 特勤中隊 勤指中心組織架構圖

大隊部包含大隊長、副大隊長、技正。

本大隊各單位職掌如下:

行政組:負責辦理一般行政、研考、文書、印信、出納、總務、後勤、裝備等事項。

督察組:負責依法辦理督察業務事項。

預防組:負責辦理預防犯罪、治安人口查(察)訪、檢肅流氓及檢肅不法幫派事項。

偵查組:負責依法辦理刑案偵查業務。

司法組:負責司法警察業務。

肅竊組:負責辦理當鋪業管理、偵辦各類刑案等事項。

經濟組:負責依法辦理經濟、詐欺業務。

紀錄組:負責辦理查捕逃犯(兵)、犯罪紀錄運用及犯罪紀錄業務等事項。

勤務指揮中心:負責各類(重大、一般)刑案、越區辦案通報、管制、調度與聯繫。

偵查第一隊:負責刑案偵查、支援文山一分局、文山二分局治安維護事項。

偵查第二隊:負責刑案偵查、支援大同分局、中正一分局治安維護事項。

偵查第三隊:負責刑案偵查、支援萬華分局、中正二分局治安維護事項。

偵查第四隊:負責刑案偵查、支援中山分局治安維護事項。

偵查第五隊:負責刑案偵查、支援信義分局、南港分局治安維護事項。

偵查第六隊:負責毒品業務及毒品查緝技術指導等相關事項、支援士林分局、北投分局治安維護事項。

偵查第七隊:負責刑案偵查、支援大安分局治安維護事項。

偵查第八隊:負責刑案偵查、支援松山分局、內湖分局治安維護事項。

科技犯罪偵查隊:負責網路犯罪案件偵查、資訊、網路犯罪偵防、通訊監察等業務、行動偵查任務。

特勤中隊:擔服巡邏、臨檢、備勤、訓練及臨時性勤務之執行,負責支援重大刑案攻堅任務及協助支援偵辦刑案。

會計室:負責依法辦理歲計、會計、統計事項。

人事室:負責依法辦理人事管理事項。